Как пишет «Сибирская католическая газета», храм построил в начале прошлого века известный архитектор Иван Носович на средства немцев, поляков и литовцев, проживавших тогда в Барнауле. В середине 30-х годов храм был конфискован, верхняя его часть разобрана, а в нижней разместилась аптека.
По постановлению правительства РФ, храм был возвращен в 1991 году. Барнаульская католическая община намерена восстановить здание в его первозданном виде по сохранившимся чертежам того времени.
Строительство предполагается закончить к столетнему юбилею храма, который будет отмечаться в 2013 году.
Городские власти не возражают против переезда аптеки, в другое место, но пока оно не определено, поскольку для покупки нового помещения в городском бюджете нет средств. Нет их и у католиков Барнаула.